拥有(yǒu )一头青色头发的男主角名字将叫作深(shēn )井 青(フカ(🍥)イ·アオ，这名字在日(rì )语中带有“深青(😧)”的(📿)意(yì )义(👋)），是(shì )一(yī )名13岁少年。青的父亲(qīn )兰(👑)顿·萨斯顿(Renton Thurston、レントン·サー(🙁)ストン(🖍))行踪不明，而母(🤷)亲(qīn )优莱卡(Eureka、エウレカ)也在10年前被美(měi )军带(🥔)走了。由(📙)于(yú )继承(chéng )了母(🙌)亲(qīn )的(de )特殊基因，使(shǐ )得他(tā )能够看(kàn )见人眼(yǎn )(🥫)所不能(🧤)看到的东西，如粒(👺)径为20nm大小的(de )光(guāng )(🧣)粒子，红外(👣)线、紫(🈁)外线等(děng )等（但在外(wài )太空这(zhè )(🚗)一特殊生(🈸)理受到限制）。小时与(yǔ )诊疗(💅)所里(🚶)的(de )老(📟)医(🐩)生(shēng )深(😝)井(jǐng ) 敏夫(💿)一同生(shēng )活，现正(😙)在(🤥)Generation Blue（蓝色世代）(🌂)中(🔙)。
　　(🛌)女主角(🎞)的(🚓)名字将是阿拉(lā )塔(tǎ )·娜露，同样是13岁，是与青一同成长的(🔝)青(qīng )梅竹马。娜露因为童年时的事故而(ér )使拥有”ユタ(🌲)”的(👅)力量(犹(yóu )(🌶)达，是日本冲(🌸)绳以占卜(🧔)为职业的(de )灵媒师(🏓)的名称)的眼睛(jīng )醒觉。娜(🦀)露有能够听懂(⛄)珊(shān )瑚(🤫)岩心声的特异(🌄)功能(néng )，这是因为(💓)珊(🛒)瑚岩的一(😫)部分(🌟)在她体内(nèi )成(🙂)长，从(❣)某种程度上来(lái )说她和(🚞)珊瑚岩存(cún )在部分融(róng )合，但(dàn )正是(🏈)因为这样，导致(zhì )她自(☔)小(xiǎo )身体(tǐ )(🚹)虚弱，需要把氧气(qì )放(fàng )入(🙎)在手(shǒu )上的吸氧器，现与父亲(🚰)、妹妹及祖母(🈶)一同(tóng )生活中。
　　本作的(de )(🎄)舞(wǔ )(🤥)台也设定在(zài )冲(chōng )绳的磐户(hù )岛(dǎo )上，当时的(de )磐户岛正进行著自(👄)治(👻)权回(💁)复运动，但在某一天，在岛上(🎑)出现(xiàn )的(de )珊瑚(hú )岩受到了(🐆)宿敌(dí )白细(xì )(🥟)胞G-Monster的(de )攻击(jī )，而(ér )为了保护(📌)磐户岛，男主角青与(📢)人型IFO（Intelligent Flying Object）相(🚊)遇，并(bìng )与(yǔ )G-Monster战斗(♑)的故事就此展开。