晴朗时节，江户川柯南（高山(shān )南(nán ) 配(😘)音）和毛利(lì )小五郎（(🎺)小山(🎗)力也(🆖) 配音）、小兰（山(shān )(🐮)崎(qí )和佳奈 配音(yīn )）以及少(shǎo )年侦探团的(😎)伙伴(🖲)们一同来到京都，他们即(jí )将登上自卫(wèi )队的宙斯(sī )盾(🏐)战舰(🐖)，体验(📞)一(yī )把出海(hǎi )作战(🍮)的感觉，期间还结识了美丽又(yòu )有着(💞)几分神(shén )(🌙)秘(📎)的女自卫队员藤(🚨)井(jǐng )七海（(🖲)柴咲(❔)幸 配音）。谁知快乐的(🙂)氛围很快被恐(kǒng )慌所替(🌞)代，战舰上(🙉)突然发(🎾)现一条断(duàn )掉(🥫)的(de )手(👃)臂，消失的自卫队员又引起军方的(de )恐慌与(🚴)猜测。原来(lái )某(mǒu )国神秘(mì )间(❕)谍(dié )(💝)X已悄悄(qiāo )登上宙(🛎)斯(sī )盾(🚗)，伺机(😊)盗取战(zhàn )(🏻)舰上的绝(jué )密情(qíng )报。
　　为了(le )找出(🏒)隐藏的对手(shǒu )，柯南和灰原(yuán )哀(āi )（林原惠美 配音）、阿笠(🍽)博(🏃)士(shì )（绪方贤(🔎)一 配音(👄)）、服(fú )部平次（堀(kū )川(📞)亮 配音(🎐)）(🍁)以及远(yuǎn )山(😳)和叶（宫村优子 配音）通(🧘)力合作(❓)，与间谍展(zhǎn )开连番(fān )斗智斗(🏸)勇的较量……